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一株高產(chǎn)纖維素酶的解淀粉芽孢桿菌分離及產(chǎn)酶優(yōu)化條件(一)

發(fā)布時間:2021-09-18 15:16 編輯者:特邀作者周世紅

纖維素酶(Cellulase)是一種可降解纖維素生成葡萄糖的酶類,其作為重要的工業(yè)酶廣泛應(yīng)用于食品、紡織、生物燃料等領(lǐng)域。近年來工農(nóng)及醫(yī)藥業(yè)得到了飛速發(fā)展,但同時也產(chǎn)生了大量的產(chǎn)業(yè)廢棄物,隨著全球環(huán)境污染問題的愈發(fā)嚴(yán)重,這些廢棄物的合理利用已成為當(dāng)前解決環(huán)境問題的焦點,如富含纖維類物質(zhì)的果蔬加工副產(chǎn)物、中藥加工殘渣及農(nóng)作物秸稈等的再利用,利用纖維素酶處理已成為重要的解決途徑之一。纖維素酶的來源廣泛,如網(wǎng)翅目、直翅目、鞘翅目等昆蟲體內(nèi)的消化液,以及微生物的代謝產(chǎn)物等,其中以微生物來源纖維素酶報道最多??僧a(chǎn)纖維素酶的微生物主要來源于動物及昆蟲的消化道,土壤及泉水、湖水的沉積物,青貯飼料,酒醅和窖泥,以及豆豉、黃豆醬、發(fā)酵茶等傳統(tǒng)發(fā)酵食品,這些微生物主要包括細(xì)菌、放線菌、酵母菌以及霉菌,其中不可培養(yǎng)的微生物也可能是纖維素酶的重要來源,故研究人員利用宏基因組技術(shù)從環(huán)境中篩選纖維素酶基因,并在可體外培養(yǎng)的大腸桿菌中表達(dá)以獲取性能優(yōu)良的纖維素酶,為纖維素酶的資源挖掘開辟了新途徑。此外,纖維素酶及纖維素酶活性微生物對加工食品的品質(zhì)及活性成分的提取具有重要的改善作用。本文擬從自然環(huán)境及發(fā)酵食品中分離篩選高活性纖維素酶產(chǎn)生菌株并優(yōu)化其產(chǎn)酶條件,旨在豐富纖維素酶活性微生物菌種資源庫,并為發(fā)酵食品生產(chǎn)、富含纖維素類廢棄物的合理利用提供菌種資源,同時也為工業(yè)用菌種的開發(fā)及其理論研究提供數(shù)據(jù)支持。

土壤、發(fā)酵豆制品(納豆、豆豉)被用作篩選纖維素酶活性菌株的樣品來源。共采集5個土壤樣品,命名為1、2、3、4、5,來源于黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)校園內(nèi)花草及樹木周圍土壤;納豆W:北海道はまなす食品株式會社;納豆R:株式會社ヤマダイフ一ズプロセシング小樽工場;豆豉F:重慶市永川豆豉食品有限公司;豆豉FS:廣東陽江豆豉有限公司。

1.1.2 培養(yǎng)基

LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨1.0g,酵母粉0.5g,氯化鈉1.0g,蒸餾水溶解至100mL,自然pH,121℃滅菌15min。固體培養(yǎng)基加入1.8%~2.0%瓊脂粉;羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)固體培養(yǎng)基:CMC-Na1.0g,蛋白胨1.0g,酵母粉0.1g,磷酸二氫鉀0.3g,硫酸鎂0.04g,氯化鈉1.0g,瓊脂粉1.6g,蒸餾水溶解至200mL,pH調(diào)至pH7.0~pH7.2,121℃滅菌15min。

1.1.3 主要試劑

剛果紅:北京博奧拓達(dá)科技有限公司;3,5-二硝基水楊酸:天津市致遠(yuǎn)化學(xué)試劑有限公司;酒石酸鉀鈉:天津市鑫鉑特化工有限公司;亞硫酸鈉:天津市光復(fù)精細(xì)化工研究所;苯酚:天津市致遠(yuǎn)化學(xué)試劑有限公司;葡萄糖:天津市北辰方正試劑廠;檸檬酸:天津市光復(fù)科技發(fā)展有限公司;羧甲基纖維素鈉:天津市天力化學(xué)試劑有限公司;以上試劑均為分析純。細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(DP302-02):天根生化科技(北京)有限公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

1.1.4 主要設(shè)備

SW-CJ-2D雙人單面凈化工作臺:蘇州凈化設(shè)備有限公司;DY04-13-43-00(LS-30)壓力蒸汽滅菌器:上海博訊實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;XMTD-204數(shù)顯式電熱恒溫水浴鍋:上海躍進(jìn)醫(yī)療器械有限公司;ME203E電子分析天平:梅特勒-托利多儀器有限公司;BSD-100培養(yǎng)箱:上海博訊實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;SP-752(PC)紫外可見分光光度計:上海光譜儀器有限公司;PB-10酸度計:賽多利斯科學(xué)儀器有限公司;H1650臺式高速離心機(jī):湘儀集團(tuán);T100-PCR儀:Bio-Rad公司。

1.2 方法

1.2.1 產(chǎn)纖維素酶菌株的分離及篩選

稱取5.0g采集樣品,無菌條件下分別接種至50mLLB液體培養(yǎng)基,37℃恒溫培養(yǎng)24h,10倍梯度稀釋發(fā)酵液,取適當(dāng)濃度稀釋液涂布于LB固體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)24h,挑取在形態(tài)學(xué)上存在差異的單菌落,進(jìn)一步劃線于LB固體培養(yǎng)基中培養(yǎng),如此重復(fù)直至純化。

將已純化分離菌株分別接種至CMC-Na固體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24h,隨后向長有菌落的CMC-Na固體培養(yǎng)基上加入0.2%剛果紅染液染色30min,再依次用蒸餾水和1mol/LNaCl溶液洗掉染液,周圍可見透明圈的菌落被認(rèn)為具有纖維素酶活性,透明圈與菌落直徑的比值越大,纖維素酶活性則越高。選取纖維素酶活性最高的菌株做進(jìn)一步菌種鑒定。

1.2.2 菌株的鑒定

1.2.2.1 形態(tài)學(xué)特征

選取初篩獲取的纖維素酶活性最高菌株,37℃培養(yǎng)于LB固體培養(yǎng)基24h,記錄其菌落形態(tài)特征,并進(jìn)行革蘭氏染色觀察其菌體細(xì)胞形態(tài)。

1.2.2.2 16SrDNA基因序列分析

提取菌株基因組DNA,并以其為模板進(jìn)行16SrDNA基因序列擴(kuò)增,擴(kuò)增引物及條件參照文獻(xiàn)。正向引物27F:5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’,反向引物1541R:5’-AAGGAGGTGATCCAGCC-3’。PCR擴(kuò)增條件:95℃變性5min;94℃1min,58℃1min,72℃2min,30個循環(huán);72℃延伸7min。PCR反應(yīng)體系(50μL):2×TaqPCRMasterMix25μL,正向引物(10μmol/L)1μL,反向引物(10μmol/L)1μL,DNA模板2μL,ddH2O21μL。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送到華大基因(北京)進(jìn)行測序。菌株的16SrDNA基因序列經(jīng)BLAST比對分析,確定與其親緣關(guān)系最近的屬,并基于16SrDNA基因序列利用MEGA5.1軟件構(gòu)建菌株與該屬內(nèi)模式菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹,進(jìn)而確定該菌株的種屬。

1.2.2.3 gyrB基因序列分析

由華大基因合成gyrB基因的PCR擴(kuò)增引物(UP-1和UP-2r)及測序引物(UP-1S和UP-2Sr)。正向擴(kuò)增引物UP-1:GAAGTCATCATGACCGTTCTGCAYGCNGGNGGNAARTTYGA,反向擴(kuò)增引物UP-2r:AGCAGGGTACGGATGTGCGAGCCRTCNACRTCNGCRTCNGTCAT;正向測序引物UP1S:GAAGTCATCATGACCGTTCTGCA,反向測序引物UP-2Sr:AGCAGGGTACGGATGTGCGAGCC。PCR反應(yīng)體系及擴(kuò)增條件參照文獻(xiàn)。PCR擴(kuò)增條件:95℃變性4min;98℃10s,62℃1min,72℃2min,30個循環(huán);72℃延伸8min。PCR反應(yīng)體系(50μL):2×TaqPCRMasterMix25μL,正向引物(10μmol/L)2μL,反向引物(10μmol/L)2μL,DNA模板1μL,ddH2O20μL。

1.2.3 培養(yǎng)條件對菌株纖維素酶活力的影響

依次考察不同發(fā)酵條件對菌株產(chǎn)纖維素酶活力的影響,包括培養(yǎng)時間(12h、24h、36h、48h、60h、72h)、培養(yǎng)溫度(33℃、35℃、37℃、39℃、41℃)、培養(yǎng)基初始pH(pH3.0、pH5.0、pH7.0、pH9.0、pH11.0)和接種量(2%、4%、6%、8%、10%)共4項指標(biāo)。

1.2.4 纖維素酶活性優(yōu)化的正交試驗設(shè)計

根據(jù)單因素試驗結(jié)果,針對每個因素分別選取3個水平,以纖維素酶活力為評價指標(biāo),進(jìn)行L9(34)正交試驗,從而確定菌株發(fā)酵產(chǎn)纖維素酶的最佳發(fā)酵條件,試驗因素與水平如表1所示。

聲明:本文所用圖片、文字來源《中國食品添加劑》,版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請與本網(wǎng)聯(lián)系

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