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新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情的爆發(fā)給世界公共衛(wèi)生安全帶來前所未有的挑戰(zhàn)。隨著新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)相關(guān)研究的不斷深入,眾多分析檢測技術(shù)相繼被應(yīng)用,推動(dòng)了病毒檢測、疫苗和創(chuàng)新療法的研發(fā),從而使疫情早日得到控制。分離技術(shù)作為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)領(lǐng)域的關(guān)鍵技術(shù),操作簡單,分離效率高,選擇性強(qiáng),在新型冠狀病毒的分離、檢測、診療及防疫中起到不可替代的作用。該文以SARS-CoV-2或COVID-19為關(guān)鍵詞在ISI Web of Science中進(jìn)行主題檢索,歸納了2020年度新型冠狀病毒相關(guān)的研究論文,簡要介紹主要的研究方向,并對國際頂級學(xué)術(shù)期刊Nature,Science,Cell的論文發(fā)表情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)。通過檢索影響因子較高的期刊,綜述了新型冠狀病毒研究中主要應(yīng)用的分離技術(shù),并從親和色譜和尺寸排阻色譜、液相色譜、磁珠分離、離心、微納分離以及電泳6個(gè)方面進(jìn)行說明。
綜述統(tǒng)計(jì)了親和色譜和尺寸排阻色譜純化的病毒相關(guān)蛋白,并介紹了其在新型冠狀病毒傳播、感染機(jī)制以及藥物篩選中的應(yīng)用;介紹了液相色譜對病毒候選藥物評估以及復(fù)雜基質(zhì)中單一成分的鑒定;介紹了磁珠分離在細(xì)胞分離、核酸提取和免疫學(xué)檢測中的應(yīng)用;介紹了離心對病毒顆粒、細(xì)胞以及血清的分離;介紹了微納分離結(jié)合其他技術(shù)以實(shí)現(xiàn)病毒蛋白的高靈敏檢測;簡要介紹了電泳在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)產(chǎn)物分析中的應(yīng)用。該文綜述了2020年度新型冠狀病毒研究和防疫檢測中分離技術(shù)的應(yīng)用情況,分析了分離技術(shù)在新型冠狀病毒檢測中發(fā)揮的作用,旨在為從事分離研究的科研工作者提供一些參考。
2020年1月爆發(fā)的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)在短時(shí)間內(nèi)迅速蔓延全球,給世界公共衛(wèi)生體系帶來了前所未有的挑戰(zhàn)。國際病毒分類委員會將引發(fā)新冠肺炎的病毒命名為嚴(yán)重性呼吸綜合征冠狀病毒2(SARS-CoV-2),它是一種單股正鏈RNA病毒(β-冠狀病毒屬),早期通過表面凸起的刺突糖蛋白(S蛋白)結(jié)合受體細(xì)胞的血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2),后經(jīng)細(xì)胞內(nèi)2型跨膜絲氨酸蛋白酶裂解ACE2并激活S蛋白來促進(jìn)病毒吸收,進(jìn)而引起病變。目前,疫情已持續(xù)1年多,全球累計(jì)確診病例超1.18億例,且仍呈增加趨勢。為了盡快控制疫情,全球科研和臨床醫(yī)護(hù)人員聯(lián)手攻關(guān),從病毒的傳播途徑、感染致病機(jī)制、快速檢測診斷、疫苗開發(fā)等多方面開展研究,在短時(shí)間內(nèi)取得了一系列突破進(jìn)展。分離技術(shù)作為生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥學(xué)等領(lǐng)域的關(guān)鍵技術(shù),在新型冠狀病毒研究中發(fā)揮了不可替代的作用。其中,以色譜為代表的現(xiàn)代分離技術(shù),在實(shí)現(xiàn)病毒微量蛋白質(zhì)純化的同時(shí)能保持蛋白質(zhì)活性和分子結(jié)構(gòu)完整,適用于發(fā)病機(jī)制、疫苗研發(fā)、臨床治療等研究。而以離心為代表的傳統(tǒng)分離技術(shù),是新型冠狀病毒研究的基礎(chǔ)技術(shù)手段,方法簡單快捷,可初步分離病毒、細(xì)菌等大顆粒物質(zhì)。
本文以“COVID-19”或“SARA-CoV-2”為關(guān)鍵詞,在ISI Web of Science數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行主題檢索,截至2020年12月31日為止,相關(guān)期刊論文已達(dá) 26 160 篇,研究方向包括普通內(nèi)科學(xué)、公共環(huán)境衛(wèi)生、傳染病學(xué)、藥理學(xué)、分子生物學(xué)、化學(xué)等(見圖1)。其中,國際頂級學(xué)術(shù)期刊Nature, Science和Cell分別發(fā)表新型冠狀病毒相關(guān)論文62、58和43篇,論文中應(yīng)用的分離技術(shù)主要有親和色譜(AC)和尺寸排阻色譜(SEC)、液相色譜、磁珠分離和離心,研究內(nèi)容涉及新型冠狀病毒的傳播、溯源、治療藥物、疫苗研發(fā)、臨床防治和疫情防控等方面。分析化學(xué)類專業(yè)期刊發(fā)表相關(guān)論文有限,代表性期刊Analytical Chemistry在2020年全年僅發(fā)表14篇新型冠狀病毒研究論文,其中2篇報(bào)道采用微納分離技術(shù)對病毒進(jìn)行高靈敏檢測。
本文總結(jié)了分離技術(shù)在新型冠狀病毒研究、檢測和防疫中的應(yīng)用,從親和色譜和尺寸排阻色譜、液相色譜、磁珠分離、離心、微納分離和電泳6個(gè)方面進(jìn)行介紹。
親和色譜和尺寸排阻色譜是Nature, Science和Cell期刊報(bào)道文獻(xiàn)中使用最頻繁的蛋白質(zhì)純化技術(shù)。其中,AC是通過生物分子與功能配基的特異性作用對目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行分離純化,是實(shí)驗(yàn)室中生物大分子分離純化最具特異性和高效性的技術(shù),但配基昂貴且偶聯(lián)技術(shù)復(fù)雜,限制了其應(yīng)用;SEC是根據(jù)相對分子質(zhì)量差異對待測物中各組分進(jìn)行分離,優(yōu)勢在于分辨率高,操作簡單,但對于樣品純度要求很高,因此常用于親和色譜后蛋白質(zhì)的進(jìn)一步純化。在當(dāng)前新型冠狀病毒研究中,AC與SEC常被用于純化病毒表面S蛋白、ACE2、S蛋白受體結(jié)合域(RBD)等。
Shang等使用鎳離子金屬螯合親和色譜(Ni-NTA)對多聚組氨酸標(biāo)簽(His6-tag)標(biāo)記的SARS-CoV-2和SARS-CoV的RBD以及ACE2胞外域分離純化,使用Protein A親和色譜純化重組人APOM蛋白(Fc-tag)標(biāo)記的ACE2,隨后用SEC對蛋白質(zhì)進(jìn)一步純化。通過比較分析ACE2對SARS-CoV-2、SARS-CoV以及蝙蝠冠狀病毒RaTG13的識別差異,揭示SARS-CoV-2在動(dòng)物和人類之間的潛在傳播。以同樣方法分離純化SARS-CoV-2、SARS-CoV和中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)的RBD以及ACE2胞外域后,Shang等對比分析ACE2與3種病毒RBD的結(jié)合差異,為病毒干擾策略研究提供參考。
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在新型冠狀病毒肺炎疫情暴發(fā)以來,武漢病毒研究所申請的瑞得西韋治療2019新型冠狀病毒的用途專利引起了廣泛關(guān)注,盡管用途發(fā)明是醫(yī)藥化學(xué)領(lǐng)域?qū)@闹匾问剑侨藗儗ζ涞恼J(rèn)識程度卻并不深刻,本文將從用途發(fā)明的定義、分類及具體案例探討醫(yī)藥化學(xué)領(lǐng)域用途發(fā)明的創(chuàng)造性評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)及撰寫策略。
了解更多> >目前核酸檢測試劑品牌眾多,檢測靶標(biāo)位置、靈敏度不盡相同,為更好地滿足新冠核酸檢測需求,中國計(jì)量院全新推出新型冠狀病毒全序列假病毒標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。
了解更多> >親和色譜和尺寸排阻色譜是Nature, Science和Cell期刊報(bào)道文獻(xiàn)中使用最頻繁的蛋白質(zhì)純化技術(shù)。其中,AC是通過生物分子與功能配基的特異性作用對目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行分離純化,是實(shí)驗(yàn)室中生物大分子分離純化最具特異性和高效性的技術(shù),但配基昂貴且偶聯(lián)技術(shù)復(fù)雜,限制了其應(yīng)用;SEC是根據(jù)相對分子質(zhì)量差異對待測物中各組分進(jìn)行分離,優(yōu)勢在于分辨率高,操作簡單,但對于樣品純度要求很高,因此常用于親和色譜后蛋白質(zhì)的進(jìn)一步純化。在當(dāng)前新型冠狀病毒研究中,AC與SEC常被用于純化病毒表面S蛋白、ACE2、S蛋白
了解更多> >Gao等用Ni-NTA親和色譜柱純化了Nsp 12、Nsp 7和Nsp 8,解析了該聚合酶與抗病毒藥物瑞德西韋(remdesivir)的結(jié)合方式。Riva等利用Ni-NTA親和色譜柱對SARS-CoV-2的木瓜蛋白酶樣蛋白酶(PLpro)和主蛋白酶(Mpro)進(jìn)行純化,從約 12 000 個(gè)臨床階段的小分子藥物中篩選出13種具有治療效果的小分子抑制劑。Yuan研究組將Protein G親和柱用于患者體內(nèi)SARS-CoV特異性人類單克隆抗體(CR3022)的純化,研究發(fā)現(xiàn)CR3022可有效結(jié)合SA
了解更多> >新型冠狀病毒研究已取得一定進(jìn)展,分離技術(shù)在其中發(fā)揮著重要作用。其中,AC和SEC廣泛用于病毒相關(guān)蛋白質(zhì)純化中;精密儀器制造業(yè)的發(fā)展,促使HPLC分離效率的提升,是完成高靈敏度、快速解決病毒代謝組學(xué)分析的關(guān)鍵手段;新材料和電子技術(shù)的進(jìn)步,帶動(dòng)磁珠和微納分離技術(shù)的靈敏度提升和應(yīng)用范圍拓展,尤其是對化學(xué)試劑消耗降低,實(shí)現(xiàn)了對環(huán)境的友好,是解決細(xì)胞分析、核酸分離和免疫學(xué)檢測的首選技術(shù);傳統(tǒng)的離心技術(shù)在病毒顆粒和細(xì)胞分離中發(fā)揮著不可替代的作用;電泳技術(shù)主要用于PCR產(chǎn)物分析。
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