北方偉業(yè)計(jì)量集團(tuán)有限公司
將化合物、靶點(diǎn)、信號(hào)通路的相互作用整理到Excel表格中,將數(shù)據(jù)導(dǎo)入到Cytoscape 3.6.1軟件,用Network Analyzer插件構(gòu)建并分析舒筋活血膠囊“化合物-靶點(diǎn)-信號(hào)通路”的網(wǎng)絡(luò)藥理圖。其中化合物、靶蛋白和作用通路用節(jié)點(diǎn)表示,兩節(jié)點(diǎn)間的交互關(guān)系為邊,有效性賦值的公式如下,具體數(shù)值見(jiàn)表4。
E=20%×e0+80%×(e1+e2+e3+e4)(1)
公式中,E——有效性賦值;
e0——化合物對(duì)應(yīng)的關(guān)鍵靶點(diǎn)數(shù);
e1——靶點(diǎn)免疫調(diào)控路徑數(shù);
e2——靶點(diǎn)調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)路徑數(shù);
e1——靶點(diǎn)調(diào)節(jié)代謝過(guò)程路徑數(shù);
e1——靶點(diǎn)調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖路徑數(shù)
采用蛛網(wǎng)模式結(jié)合質(zhì)量標(biāo)志物篩選的五原則構(gòu)建五維特征網(wǎng)絡(luò),通過(guò)計(jì)算回歸面積來(lái)進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。
構(gòu)建數(shù)學(xué)模型,公式如下:
式中,S——候選化合物的回歸面積;
α——相鄰兩個(gè)維度之間的夾角;
P——候選化合物不同維度的得分。
舒筋活血膠囊中各味藥材含有的主要化合物28個(gè),由于原藥材和復(fù)方制劑中的化學(xué)成分不同,基于化合物的傳遞與溯源原則,賦予可傳遞到制劑中的個(gè)成分?jǐn)?shù)值Pi(制劑中成分)=30、Pii(非制劑中成分)=10;在配伍原則上,根據(jù)生藥在復(fù)方中君臣佐使的配伍原則,賦予40個(gè)成分?jǐn)?shù)值Pi(君)=30、Pii(臣)=20、Piii(佐使)=10;在特有性原則中,九個(gè)藥材中的特有性成分有18個(gè),賦予18個(gè)特有性成分?jǐn)?shù)值Pi=30、非特有性成分賦值Pi=10;在有效性原則中,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究方法,舒筋活血膠囊治療骨質(zhì)疏松癥篩選出16個(gè)有效性成分,按照1.7(1)式計(jì)算將16個(gè)化學(xué)成分賦值,具體數(shù)值如表3所示;在可測(cè)性原則中,中國(guó)藥典中九味藥材中的定量成分6個(gè)賦予數(shù)值Pi=30,有文獻(xiàn)報(bào)道其含量測(cè)定方法的化學(xué)成分賦值Pi=10;無(wú)文獻(xiàn)報(bào)道其含量測(cè)定方法的化合物賦值Pi=0。
將數(shù)值帶入到“1.8”的數(shù)學(xué)模型中,結(jié)果見(jiàn)表5。通過(guò)計(jì)算總分繪制“蛛網(wǎng)模式圖”如圖4所示,計(jì)算28個(gè)成分的回歸面積見(jiàn)圖5,由圖可知,排名前7的成分有羥基紅花黃色素A、絡(luò)石苷、刺五加苷B、α-香附酮、原兒茶酸、原兒茶醛和4-甲氧基水楊醛,其中4-甲氧基水楊醛為目前舒筋活血膠囊現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)中的指標(biāo)成分。
本文基于質(zhì)量標(biāo)志物篩選的五原則即傳遞與溯源、特有性、復(fù)方配伍、有效性和可測(cè)性,賦予舒筋活血膠囊中各化學(xué)成分的綜合得分,繪制“蛛網(wǎng)模式”圖,最終篩選出君藥紅花中的羥基紅花黃色素A、臣藥絡(luò)石藤中的絡(luò)石苷、君藥槲寄生中的刺五加苷B、君藥香附中的α-香附酮、君藥狗脊中的原兒茶酸和原兒茶醛以及臣藥香加皮中的4-甲氧基水楊醛這7個(gè)化合物為舒筋活血膠囊的關(guān)鍵質(zhì)量標(biāo)志物,可作為舒筋活血膠囊的質(zhì)控指標(biāo)。該方法為中藥復(fù)方的指標(biāo)成分選擇提供參考依據(jù),同時(shí)也為中藥復(fù)方提供了一種新的質(zhì)量控制模式。
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了解更多> >雞血藤為豆科植物密花豆Spatholobus suberectus Dunn的干燥藤莖,含有的化合物類(lèi)型主要有黃酮類(lèi)、萜類(lèi)、蒽醌類(lèi)、木脂素類(lèi)和揮發(fā)油類(lèi),其中芒柄花素為特征性成分,藥理活性涉及抗氧化、抗病毒、抗癌、抗血小板凝集、調(diào)節(jié)血脂以及保護(hù)肝損傷等方面。
了解更多> >判斷中藥復(fù)方有效性的指標(biāo)是靶點(diǎn)的有無(wú)及作用的強(qiáng)弱,將收集的所有活性化合物輸入到Genecards數(shù)據(jù)庫(kù),收集所有活性成分和疾病“Osteoporosis”靶點(diǎn),篩選出每個(gè)化合物與疾病“Osteoporosis”的相同靶點(diǎn)。故在Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)中,輸入整理的相同靶點(diǎn)基因名稱(chēng)進(jìn)行檢索,得到基因的ID。將上述獲得的基因的ID輸入到DAVID數(shù)據(jù)庫(kù),進(jìn)行KEGG通路富集分析,富集分析后將所得的結(jié)果設(shè)置成FDR<0.05、P<0.01作為顯著性強(qiáng)的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選,篩選出重要的信號(hào)通路并分析。
了解更多> >本文基于質(zhì)量標(biāo)志物篩選的五原則即傳遞與溯源、特有性、復(fù)方配伍、有效性和可測(cè)性,賦予舒筋活血膠囊中各化學(xué)成分的綜合得分,繪制“蛛網(wǎng)模式”圖,最終篩選出君藥紅花中的羥基紅花黃色素A、臣藥絡(luò)石藤中的絡(luò)石苷、君藥槲寄生中的刺五加苷B、君藥香附中的α-香附酮、君藥狗脊中的原兒茶酸和原兒茶醛以及臣藥香加皮中的4-甲氧基水楊醛這7個(gè)化合物為舒筋活血膠囊的關(guān)鍵質(zhì)量標(biāo)志物,可作為舒筋活血膠囊的質(zhì)控指標(biāo)。該方法為中藥復(fù)方的指標(biāo)成分選擇提供參考依據(jù),同時(shí)也為中藥復(fù)方提供了一種新的質(zhì)量控制模式。
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