2、單核苷酸多態(tài)性和小片段插入與缺失的分析

與參考基因組相比，Yarrowia lipolytica BBE-17共有43921個單核苷酸多態(tài)性（SNP）變化（圖3），其中42577個是純合SNP，1344個是雜合SNP，27515個是轉(zhuǎn)換的SNP，16406個是顛換的SNP，有7871個是同義突變，3711個是非同義突變；位于基因間區(qū)的SNP突變有32339個，每1000bp序列平均有2.4個單核苷酸多態(tài)性變化。整個基因組有8078個小片段插與缺失變化（InDel），其中插入的片段是3924個，缺失的片段是4154個，有7740個是純合變化，有338個是雜合變化。有4256個基因發(fā)生了單核苷酸多態(tài)性變化，但是沒有基因發(fā)生小片段插入或缺失的變化。

3、基因組結(jié)構(gòu)變異分析

基因組結(jié)構(gòu)變異（SV）指基因組水平上大片段的插入，缺失、倒置、易位等序列。與參考基因組比對發(fā)現(xiàn)，有129個大片段的基因組結(jié)構(gòu)變異（圖4）。其中缺失片段106個，倒置片段2個，染色體內(nèi)部遷移7個，染色體間的遷移14個，有44個發(fā)生在基因間區(qū)，64個結(jié)構(gòu)變異發(fā)生在基因中。份BBE-17結(jié)構(gòu)變異所涉及的基因有109個，全部為缺失型變化（表1）。

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