北方偉業(yè)計量集團有限公司
2結果
2.1 YXST入血成分的鑒別
根據(jù)前期對YXST化學成分定性分析的結果,本研究對YXST灌胃給藥前后的大鼠血漿進行比對分析,通過提取母離子、比較保留時間和質(zhì)譜裂解規(guī)律,同時結合文獻和對照品信息,對YXST的入血成分進行了鑒別。給藥前后大鼠血漿在正負離子模式下的總離子流圖見圖1,從中共定性鑒別出26個原型成分,分別為葛根素、甘草苷、丹酚酸B、靈芝酸A、黃連堿、藥根堿等,具體信息見表1。
2.2靶點收集與YXST治療冠心病潛在靶點的篩選
通過檢索STITCH、TCMSP和Binding DB數(shù)據(jù)庫,收集得到19個入血成分對應的655個靶點,合并后共得287個成分靶點。根據(jù)TTD、DrugBank、PharmGKB、MalaCards和CTD數(shù)據(jù)庫,合并去重后共獲得199個冠心病相關的疾病靶點。并不是所有的入血成分靶點都能發(fā)揮特定藥效。因此,首先將287個成分靶點與199個疾病靶點進行關聯(lián),篩選得到42個重疊的靶點,即為YXST治療冠心病的直接作用靶點,結果見圖2。此外,為進一步分析與疾病靶點存在間接作用的成分靶點,把成分靶點與疾病靶點導入STRING數(shù)據(jù)庫進行PPI分析,將獲得的數(shù)據(jù)利用Cytoscape進行可視化。其中,成分靶點與疾病靶點不能直接或間接與彼此相互作用的節(jié)點被去除。再利用Network Analyzer插件對該PPI網(wǎng)絡中所有節(jié)點的degree值進行分析,計算得平均degree為18.33。篩選degree大于平均degree 2倍的節(jié)點作為hub node,共有54個節(jié)點符合標準。在這些hub node中,有40個是成分靶點,26個是疾病靶點,除去兩者重疊的12個靶點,剩下的28個成分靶點即為YXST治療冠心病的間接作用靶點,結果見圖2。將42個直接靶點與28個間接靶點合并即得YXST治療冠心病的潛在靶點。70個潛在靶點信息見圖2。
2.3功能注釋及通路分析
對YXST治療冠心病的潛在靶點進行GO功能注釋分析,結果見圖3。70個潛在靶點主要富集于胞外刺激反應、氧化應激反應、炎癥反應的調(diào)節(jié)、活性氧代謝過程的正調(diào)控、藥物反應等生物過程(biological process,BP);主要涉及膜筏、膜區(qū)、囊腔、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔、血漿脂蛋白顆粒等細胞組分(cellular component,CC);主要影響MAP激酶活性、信號轉導-絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、核心啟動子序列特異性DNA結合、血紅素結合、受體調(diào)節(jié)活性、細胞因子受體結合等分子功能(molecular function,MF)。進一步對潛在靶點進行KEGG通路富集分析發(fā)現(xiàn),YXST治療冠心病主要涉及晚期糖基化終末產(chǎn)物-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(advanced glycationend products-receptor foradvanced glycationend products,AGE-RAGE)、動脈粥樣硬化、TNF、IL-17、C型凝集素受體、Th17細胞分化、Toll樣受體等信號通路,結果見圖4。
2.4網(wǎng)絡的構建及分析
YXST“入血成分-潛在靶點”網(wǎng)絡共包含86個節(jié)點,矩形表示入血成分有16個,圓形表示潛在靶點有70個;邊共有191條,表示化合物和靶點之間的聯(lián)系,結果見圖5。利用Network Analyzer插件對網(wǎng)絡的拓撲性質(zhì)進行分析,以節(jié)點度、介數(shù)中心度和緊密中心度為標準對入血成分和潛在靶點分別進行篩選,詳細信息見表2。3項數(shù)值均在平均值以上的關鍵化合物有3個,為大豆苷、小檗堿、葛根素。3項數(shù)值均在平均值以上的關鍵靶點有16個,為PTGS2、PTGS1、NOS2、ESR1、NOS3、HSP90AA1、ADRB2、ESR2、MAPK14、CASP3、JUN、PPARG、AKT1、TNF、MAPK3、MAPK1。這些成分和靶點很有可能是YXST治療冠心病的藥效物質(zhì)和作用靶點。
聲明:本文所用圖片、文字來源《中國現(xiàn)代應用藥學》2020年8月,版權歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權等問題,請與本網(wǎng)聯(lián)系
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